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姓名：李玉梅

学位：理学博士学位

毕业院校：北京大学

电子邮箱：ymli12@suda.edu.cn

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个人简介

李玉梅博士师从生物信息学专家李川昀教授（北京大学）和李蔚（Wei Li）教授（美国加州大学尔湾分校），并在博士后期间得到生物统计学专家李婧翌（Jingyi Jessica Li）教授（加州大学洛杉矶分校）的指导，具有生物学、信息学和统计学的交叉背景。曾获美国George E. Hewitt医学研究基金会博士后奖学金资助。于2023年2月加盟18新利体育 基础医学与生物科学学院，成立医学基因组与表观基因组学课题组。


李玉梅博士主要采用生物信息学方法结合高通量、多组学数据，对核小体的静态占位、动态更新和潜在临床应用等方面进行了研究，一系列的研究结果以第一/共同第一作者发表在PNAS, Molecular Cell, Circulation Research, Genome Biology, Genome Medicine等杂志上。


在研项目：

1. 国家自然科学基金青年科学基金项目，2025-2027，主持

2. 江苏省自然科学基金青年基金项目，2024-2027，主持

3. 江苏特聘教授，2023-2026，主持

4. 18新利体育 海外高层次人才引进启动经费，2023-2026，主持


代表性论文：

1.Yumei Li*, Jianfeng Xu*, Chaorong Chen*, Zhenhai Lu*, Desen Wan, Diange Li, Jason S. Li, Allison J. Sorg, Curt C. Roberts, Shivani Mahajan, Maxime A. Gallant, Itai Pinkoviezky, Ya Cui, David J. Taggart, Wei Li. Multimodal Epigenetic Sequencing Analysis (MESA) of Cell-free DNA for Non-invasive Colorectal Cancer Detection. Genome Medicine. 2024

2. Yumei Li*, Xinzhou Ge*, Fanglue Peng, Wei Li, Jingyi Jessica Li. Exaggerated false positives by popular differential expression methods when analyzing human population samples. Genome Biology. 2022

3. Deepanwita Sengupta*, Liyong Zeng*, Yumei Li*, Simone Hausmann, Debopam Ghosh, Gang Yuan, Thuyen N Nguyen, Ruitu Lyu, Marcello Caporicci, Ana Morales Benitez, Garry L Coles, Vladlena Kharchenko, Iwona Czaban, Dulat Azhibek, Wolfgang Fischle, Mariusz Jaremko, Ignacio I Wistuba, Julien Sage, Łukasz Jaremko, Wei Li, Pawel K Mazur, Or Gozani. NSD2 dimethylation at H3K36 promotes lung adenocarcinoma pathogenesis. Molecular Cell. 2021

4. Yumei Li*, Qing Sunny Shen*, Qi Peng*, Wanqiu Ding, Jie Zhang, Xiaoming Zhong, Ni A An, Mingjun Ji, Wei-Zhen Zhou, Chuan-Yun Li. Polyadenylation- related isoform switching in human evolution revealed by full-length transcript structure. Briefings in Bioinformatics. 2021

5. Yumei Li*, Shanshan Ai*, Xianhong Yu*, Chen Li, Xin Li, Yanzhu Yue, Yusheng Wei, Chuan-Yun Li, and Aibin He. Replication-independent histone turnover underlines the epigenetic homeostasis in adult heart. Circulation Research. 2019

6. Yumei Li*, Chen Li*, Shuxian Li, Qi Peng, Ni A. An, Aibin He, and Chuan-Yun Li. Human exonization through differential nucleosome occupancy. PNAS. 2018

7. Shanshan Ai*, Xianhong Yu*, Yumei Li*, Yong Peng, Chen Li, Yanzhu Yue, Ge Tao, Chuan-Yun Li, William T. Pu, and Aibin He. Divergent Requirements for EZH1 in Heart Development Versus Regeneration. Circulation Research. 2017


教育经历

  • 博士研究生,2014年-2019年,生物信息学,北京大学,博士
  • 本科,2010年-2014年,生物科学,南开大学,学士

工作经历

  • 2019年11月-2023年1月,美国加州大学尔湾分校,生物信息学方向研究,博士后研究员
  • 2023年2月-至今,18新利体育 基础医学与生物科学学院,生物信息学方向研究,特聘教授

社会职务

研究领域

医学基因组与表观基因组学课题组主要通过运用和开发生物信息学方法，结合高通量组学数据，研究核小体相关的表观遗传调控在基础生命过程和疾病发生发展中的功能，以期理解生命过程的基本调控规律和发现其潜在的临床应用价值。


主要研究方向包括：

（1）核小体相关的表观遗传调控在基础生物学过程和疾病发生发展中的功能研究；（2）基于血液等体液游离DNA的疾病无创诊断方法的开发；（3）多组学数据的处理和分析算法的评估和开发。



社会职务

开授课程

科研项目

论文

  • 1、Exaggerated false positives by popular differential expression methods when analyzing human population samples,Genome Biology,2022,Yumei Li,Xinzhou Ge et al.
  • 2、NSD2 dimethylation at H3K36 promotes lung adenocarcinoma pathogenesis,Molecular Cell,2021,Deepanwita Sengupta, Liyong Zeng, Yumei Li et al.
  • 3、Polyadenylation-related isoform switching in human evolution revealed by full-length transcript structure,Briefings in Bioinformatics,2021,Yumei Li, Qing Sunny Shen, Qi Peng et al.
  • 4、Replication-Independent Histone Turnover Underlines the Epigenetic Homeostasis in Adult Heart,Circulation Research,2019,Yumei Li, Shanshan Ai, Xianhong Yu et al.
  • 5、Human exonization through differential nucleosome occupancy,PNAS,2018,Yumei Li, Chen Li et al.
  • 6、Divergent Requirements for EZH1 in Heart Development Versus Regeneration,Circulation Research,2017,Shanshan Ai, Xianhong Yu, Yumei Li et al.

科技成果

软件著作 专利

荣誉及奖励

招生信息

医学系统生物学、生物信息学。

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