报告题目：Conserved gene regulatory network underlying the development of lateral neural borders in bilateria

报告人：刘晓  博士

报告时间：2017年11月10日（周五）下午14:30

报告地点：18新利体育 神经18新利备用网站 所会议室

刘晓，博士。1994年在南京大学生物系获得学士学位，1997年在北京大学细胞遗传系获得硕士学位。在新泽西医科及牙医大学学习两年后，转入约翰霍普金斯医学院，在生物物理系Neil Clarke实验室以酵母为模型进行基因调控的功能基因组研究，于2005年获得博士学位。然后进入斯坦福医学院发育生物学系Stuart Kim实验室做博士后，开始了他的线虫功能基因组学研究。

2012年刘晓博士加入清华大学建立了他自己的实验室，继续以秀丽杆线虫为模型，开发和利用高通量组学技术，在单细胞精度建立基因调控网络，探究细胞命运在发育和进化过程中多样化的分子机制。已经发现了一系列以前未知的分子发育生物学现象。

代表作：

1. Li, Y., Zhao, D., Horie, T., Chen, G., Bao, H., Chen, S., Liu, W., Horie, R., Liang, T., Dong, B., Feng, Q., Tao, Q. and Liu, X.*. (2017) A Conserved Gene Regulatory Module Specifies Lateral Neural Borders Across Bilaterians. PNAS 114, E6352
2. Liu, W., Yu, E., Chen, S., Ma, X., Lu, Y. and Liu, X.*. (2017) Spatiotemporal expression profiling of long intervening noncoding RNAs in Caenorhabditis elegans. Scientific Reports 7, 5195
3. Wei, X., Xu, Z., Wang, G., Hou, J., Ma, X., Liu, H., Liu, J., Chen, B., Luo, M., Xie, B., Li, R., Ruan, J. and Liu, X.*. (2017) pBACode: a random-barcode-based high-throughput approach for BAC paired-end sequencing and physical clone mapping. Nucleic Acids Rsearch 45, e52
4. Ma, X., Zhan, G., Sleumer, M.C., Chen, S., Liu, W., Zhang, M.Q. and Liu, X.*. (2016) Analysis of C. elegans muscle transcriptome using trans-splicing-based RNA tagging (SRT). Nucleic Acids Rsearch 44, e156
5. Liu, X., Long, F., Peng, H., Aerni, S.J., Jiang, M., Sánchez-Blanco A., Murray. J.I., Preston, E., Mericle, B., Batzoglou, S., Myers, G., and Kim, S.K. (2009). Analysis of cell fate from single-cell gene expression profiles in C. elegans. Cell 139: 623 – 633
6. Liu, X. and Clarke, N. D. (2002) Rationalization of gene regulation by a eukaryotic transcription factor: calculation of regulatory region occupancy from predicted binding affinities. J. Mol. Biol. 323:1-8.